Το νησιωτικό σύμπλεγμα της Σαντορίνης αποτελείται από τη Θήρα, τη Θηρασία, το Ασπρονήσι και την Παλαιά και τη Νέα Καμένη (ηφαίστεια).

Βρίσκεται στο νοτιότερο μέρος των Κυκλάδων στο Αιγαίο Πέλαγος, περίπου 117 χλμ. (63 ναυτικά μίλια) βόρεια της Κρήτης και περίπου 200 χλμ. (108 ναυτικά μίλια) νοτιοανατολικά της ηπειρωτικής Ελλάδας.

Ο Δήμος Θήρας, ο οποίος καλύπτει όλη τη Θήρα και τη Θηρασία, αποτελείται από 14 τοπικά διαμερίσματα: Ακρωτήρι, Βόθωνας, Βουρβούλος. Εμπορείο, Επισκοπή Γωνιά, Έξω Γωνιά, Ημεροβίγλι, Θήρα (Φηρά), Θηρααία, Καρτεράδος, Μεγαλοχώρι, Μεσαριά, Οία, Πύργος Καλλίστης.

Η Σαντορίνη μαζί με την Ανάφη, την Ίο, τη Σϊκινο και τη Φολέγανδρο συνιστούν την Περιφερειακή Ενότητα Θήρας, η οποία ανήκει στην Περιφέρεια Νοτίου Αιγαίου.